Первое нападение шведов на Валаам произошло в 11 веке. Тогда русские войска разгромили их, и, раздосадованные столь позорным поражением, возвращаясь домой, остатки шведской армии подошли к острову на кораблях и напали на беззащитное поселение.
Они просто разграбили и сожгли монашескую обитель, пользуясь тем, что не встретили практически никакого сопротивления. В древних летописях есть записи о том, что мощи преподобных Сергия и Германа, основателей и небесных заступников Валаамской обители, были перенесены в Новгород во время шведского нашествия, случившегося в 1163-1164 годах.
Обратно на Валаам, мощи были возвращены лишь в 1182 году, когда опасность шведского нашествия миновала. Чтобы уберечь их от осквернения чужеземцами и иноверцами, глубоко в скале высекли могилу, в которую и поместили святыню.
Мощи преподобных вернулись на Валаам 11 сентября по новому стилю, или 24 по старому. В память об этом знаменательном событии, каждый год на Валааме проходит церковное празднество. А о чудесах, творимых святыней, имеются многочисленные записи в монастырских летописях. Самый первый монастырь на Валааме, сожженный шведами дотла, был освящен во имя Пресвятой Троицы.
Эти сведения стали известны из жития преподобного Авраамия Ростовского. Монастырь был выстроен из дерева, поэтому и сгорел быстро и до основания. На его месте возвели новый, после того, как опасность разорения исчезла. Новый храм выстроили каменным и освятили уже в честь Преображения Господня.
Церковь получилась очень красивой, высокой и величественной, с несколькими приделами. Такое великолепие смогли возвести, благодаря многочисленным пожертвованиям на благое дело. Для монахов были предусмотрены удобные кельи, те же, кто прибывал в обитель со стороны, селились в гостинице, за монастырской стеной. Шведские войска вновь пошли в атаку на российские земли в 16 веке. Тогда же Валаам вновь оказался на их пути.
Очередное нападение на монастырь произошло 20 февраля 1578 года. Цена оказалась велика: европейские «цивилизаторы», за веру до смерти замучили 18 старцев и 16 послушников, проживавших тогда на Валааме. С тех пор их имена упоминаются в монашеских молитвах.
На этом монастырские бедствия не закончились. В 1581 году 134 человека погибло во время эпидемии чумы, разразившейся на острове. А затем на монастырь снова напали шведские войска, опять полностью разорив обитель и уничтожив большинство построек.
Братия скрывалась от варваров в лесах острова, а часть монахов нашла приют в Антониевом Дымковском монастыре. В 1595 году был заключен мир со шведами.
Тогда же России были возвращены новгородские земли, завоеванные шведскими войсками. Не был забыт и Валаамский монастырь. Царь Федор Иоаннович повелел выделить из казны средства на восстановление обители. Тогда были заново возведены кельи, церкви, отлили новые колокола. Довольно большую сумму собрали из пожертвований.
